食品工場などで、汚染している食品等を取り扱う場所、あるいは区域のことです。
汚染作業区域には、例えば、前室、荷捌室、検収室、前処理室、その他原料や包材等の保管場所などが挙げられます。ゾーニングや動線を考える際は、汚染作用区域の影響が非汚染作業区域に及ばないように注意しなくてはなりません。